Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIRBPQ14011 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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