Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCINQ13939 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCINQ13939 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCINQ13939 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCINQ13939 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCINQ13939 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCINQ13939 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCINQ13939 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCINQ13939 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCINQ13939 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCINQ13939 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCINQ13939 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCINQ13939 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCINQ13939 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCINQ13939 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCINQ13939 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCINQ13939 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCINQ13939 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCINQ13939 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCINQ13939 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCINQ13939 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCINQ13939 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCINQ13939 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCINQ13939 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCINQ13939 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCINQ13939 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCINQ13939 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCINQ13939 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCINQ13939 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCINQ13939 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCINQ13939 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCINQ13939 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCINQ13939 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCINQ13939 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCINQ13939 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCINQ13939 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCINQ13939 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCINQ13939 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCINQ13939 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCINQ13939 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCINQ13939 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCINQ13939 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCINQ13939 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCINQ13939 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCINQ13939 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCINQ13939 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCINQ13939 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCINQ13939 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCINQ13939 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCINQ13939 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCINQ13939 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCINQ13939 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCINQ13939 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCINQ13939 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCINQ13939 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCINQ13939 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCINQ13939 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCINQ13939 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCINQ13939 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCINQ13939 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCINQ13939 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCINQ13939 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCINQ13939 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCINQ13939 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCINQ13939 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCINQ13939 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCINQ13939 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCINQ13939 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCINQ13939 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCINQ13939 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCINQ13939 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCINQ13939 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCINQ13939 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCINQ13939 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCINQ13939 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCINQ13939 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCINQ13939 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCINQ13939 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCINQ13939 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCINQ13939 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCINQ13939 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCINQ13939 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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