Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTB1Q13884 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTB1Q13884 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms