Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP1Q13829 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP1Q13829 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP1Q13829 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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