Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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TUBB3Q13509 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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TUBB3Q13509 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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TUBB3Q13509 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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TUBB3Q13509 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TUBB3Q13509 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TUBB3Q13509 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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TUBB3Q13509 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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TUBB3Q13509 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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TUBB3Q13509 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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TUBB3Q13509 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBB3Q13509 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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