Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC3Q13507 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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