Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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PMS2P3Q13401 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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PMS2P3Q13401 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PMS2P3Q13401 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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