Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE3BQ13370 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE3BQ13370 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
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