Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTA1Q13330 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTA1Q13330 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTA1Q13330 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTA1Q13330 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTA1Q13330 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA1Q13330 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA1Q13330 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA1Q13330 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA1Q13330 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA1Q13330 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA1Q13330 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA1Q13330 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA1Q13330 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA1Q13330 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTA1Q13330 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms