Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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CALCOCO2Q13137 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO2Q13137 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO2Q13137 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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