Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GRIK2Q13002 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK2Q13002 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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