Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXF1Q12946 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXF1Q12946 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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