Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 KIFC3-230ENST00000567204 516 ntTSL 413.18□□□□□ -0.33e-16■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 KIFC3-212ENST00000562984 551 ntTSL 412.5□□□□□ -0.413e-16■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 KIFC3-233ENST00000569222 443 ntTSL 312.12□□□□□ -0.473e-16■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 KIFC3-232ENST00000569112 564 ntTSL 411.9□□□□□ -0.53e-16■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 KIFC3-220ENST00000565351 297 ntTSL 1 (best)11.87□□□□□ -0.513e-16■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 KIFC3-234ENST00000569619 698 ntTSL 310.84□□□□□ -0.673e-16■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 KIFC3-222ENST00000565481 788 ntTSL 510□□□□□ -0.813e-16■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 FLCN-209ENST00000480316 786 ntTSL 29.85□□□□□ -0.838e-9■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 NAALADL1-206ENST00000526516 800 ntTSL 321.56■■□□□ 1.049e-13■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 NAALADL1-209ENST00000528977 2385 ntTSL 1 (best)18.42■□□□□ 0.549e-13■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 NAALADL1-210ENST00000529274 2427 ntTSL 1 (best)18.01■□□□□ 0.479e-13■■■■■ 35.9
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SF3A3Q12874 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.169e-13■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 NAALADL1-215ENST00000531746 1099 ntTSL 1 (best)16.01■□□□□ 0.159e-13■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 NAALADL1-214ENST00000531174 769 ntTSL 216.01■□□□□ 0.159e-13■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.039e-13■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.019e-13■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.019e-13■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 NAALADL1-219ENST00000533340 851 ntTSL 515.1■□□□□ 0.019e-13■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 NAALADL1-212ENST00000530139 563 ntTSL 314.91□□□□□ -0.029e-13■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.119e-13■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 NAALADL1-213ENST00000530995 942 ntTSL 512.33□□□□□ -0.449e-13■■■■■ 35.9
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SF3A3Q12874 NAALADL1-211ENST00000529685 604 ntTSL 310.27□□□□□ -0.779e-13■■■■■ 35.9
SF3A3Q12874 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.649e-8■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.799e-8■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.565e-7■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.357e-19■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.044e-7■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 GNPTG-205ENST00000527168 1317 ntTSL 521.04■□□□□ 0.967e-19■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.664e-7■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 GNPTG-207ENST00000529110 552 ntTSL 218.98■□□□□ 0.637e-19■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.64e-7■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 GNPTG-208ENST00000529957 922 ntTSL 518.7■□□□□ 0.587e-19■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 35.8
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SF3A3Q12874 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 35.8
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SF3A3Q12874 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.139e-8■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 35.8
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SF3A3Q12874 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 PELP1-211ENST00000573523 3878 ntTSL 215.33■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.075e-7■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.089e-8■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.214e-7■■■■■ 35.8
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SF3A3Q12874 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 CSNK1E-208ENST00000431611 814 ntTSL 512.76□□□□□ -0.379e-8■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 FAM193A-202ENST00000382839 4710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.385e-7■■■■■ 35.8
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SF3A3Q12874 SERPINA1-211ENST00000553327 581 ntTSL 310.37□□□□□ -0.757e-19■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 FAM193A-209ENST00000513898 4202 ntTSL 1 (best)9.89□□□□□ -0.835e-7■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 FAM193A-204ENST00000505311 4110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.845e-7■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 FAM193A-203ENST00000502458 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.855e-7■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 TTLL3-223ENST00000466245 616 ntTSL 38.98□□□□□ -0.977e-19■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 SERPINA1-212ENST00000554720 446 ntTSL 56.51□□□□□ -1.377e-19■■■■■ 35.8
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SF3A3Q12874 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 PSMD6-205ENST00000475036 1045 ntTSL 315.96■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 PSMD6-212ENST00000497323 717 ntTSL 515.57■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 POLR3E-215ENST00000565551 645 ntTSL 513.84□□□□□ -0.197e-9■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 PSMD6-209ENST00000482510 1176 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.495e-7■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 PSMD6-207ENST00000478185 469 ntTSL 58.79□□□□□ -15e-7■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.775e-7■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 C3-215ENST00000601008 303 ntTSL 57.6□□□□□ -1.192e-11■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 PYGB-201ENST00000216962 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.636e-8■■■■■ 35.8
SF3A3Q12874 ROCK2-204ENST00000431087 729 ntTSL 36.15□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 35.7
SF3A3Q12874 TRNAU1AP-209ENST00000495995 2040 ntTSL 218.4■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 35.7
SF3A3Q12874 TRNAU1AP-207ENST00000491577 1610 ntTSL 214.33□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 35.7
SF3A3Q12874 TRNAU1AP-205ENST00000480930 1132 ntTSL 1 (best)13.71□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 35.7
SF3A3Q12874 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 35.7
SF3A3Q12874 TRNAU1AP-202ENST00000411406 450 ntTSL 28.76□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 35.7
SF3A3Q12874 TRNAU1AP-208ENST00000495215 483 ntTSL 37.78□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 35.7
SF3A3Q12874 TRNAU1AP-210ENST00000497790 573 ntTSL 35.34□□□□□ -1.553e-6■■■■■ 35.7
SF3A3Q12874 TRNAU1AP-204ENST00000464880 609 ntTSL 34.04□□□□□ -1.763e-6■■■■■ 35.7
SF3A3Q12874 GCN1-205ENST00000548821 504 ntTSL 38.13□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 35.7
SF3A3Q12874 SH3D21-201ENST00000453908 2408 ntAPPRIS P1 TSL 522.32■■□□□ 1.161e-9■■■■■ 35.6
SF3A3Q12874 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.071e-9■■■■■ 35.6
SF3A3Q12874 SH3D21-204ENST00000496636 383 ntTSL 38.37□□□□□ -1.071e-9■■■■■ 35.6
SF3A3Q12874 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 35.6
SF3A3Q12874 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 35.6
SF3A3Q12874 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 35.6
SF3A3Q12874 PISD-213ENST00000474017 1760 ntTSL 517.77■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 35.6
SF3A3Q12874 PISD-212ENST00000473770 2378 ntTSL 517.47■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 35.6
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