Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPTFQ12830 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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