Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 MTR4YJL050W 3222 nt3.52□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 KAR1YNL188W 1302 nt3.52□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YDL199CYDL199C 2064 nt3.52□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YDR090CYDR090C 933 nt3.52□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YDR149CYDR149C 708 nt3.52□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 MIG3YER028C 1185 nt3.52□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 LSM1YJL124C 519 nt3.52□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YPL168WYPL168W 1293 nt3.52□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YBR292CYBR292C 372 nt3.52□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 BAR1YIL015W 1764 nt3.52□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 EXO5YBR163W 1758 nt3.52□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 MSR1YHR091C 1932 nt3.52□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 STE24YJR117W 1362 nt3.51□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 TFB2YPL122C 1542 nt3.51□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 KAP95YLR347C 2586 nt3.51□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 PMI40YER003C 1290 nt3.51□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 GPP2YER062C 753 nt3.51□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt3.51□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 DOG1YHR044C 741 nt3.51□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 MRP8YKL142W 660 nt3.51□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.51□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 ATG34YOL083W 1239 nt3.51□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YBR013CYBR013C 390 nt3.51□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 CCL1YPR025C 1182 nt3.51□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 ERV15YBR210W 429 nt3.51□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 TOP1YOL006C 2310 nt3.51□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 SST2YLR452C 2097 nt3.51□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YNR063WYNR063W 1824 nt3.51□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 SET1YHR119W 3243 nt3.51□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 ALG8YOR067C 1734 nt3.5□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 TAM41YGR046W 1158 nt3.5□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 RSM26YJR101W 801 nt3.5□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 VPS25YJR102C 609 nt3.5□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YLR290CYLR290C 834 nt3.5□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 GLO1YML004C 981 nt3.5□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YML094C-AYML094C-A 402 nt3.5□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt3.5□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YPR077CYPR077C 372 nt3.5□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 RPN2YIL075C 2838 nt3.5□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 AKR1YDR264C 2295 nt3.5□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 MIP6YHR015W 1980 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 NUP60YAR002W 1620 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 OPI6YDL096C 327 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 TCA17YEL048C 459 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 MEI4YER044C-A 1227 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YJR037WYJR037W 384 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 PBA1YLR199C 831 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YAR070CYAR070C 300 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 ILV5YLR355C 1188 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 INN1YNL152W 1230 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 CPR8YNR028W 927 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 HUT1YPL244C 1020 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 STP1YDR463W 1560 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 SKN7YHR206W 1869 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 PRP22YER013W 3438 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 MIG1YGL035C 1515 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 HUL5YGL141W 2733 nt3.49□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 FAS1YKL182W 6156 nt3.48□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YML096WYML096W 1578 nt3.48□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 snR78snR78 87 nt3.48□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 FRQ1YDR373W 573 nt3.48□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YGR126WYGR126W 693 nt3.48□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 AGE2YIL044C 897 nt3.48□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 SNX4YJL036W 1272 nt3.48□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YJR111CYJR111C 852 nt3.48□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 FYV6YNL133C 522 nt3.48□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YBR089WYBR089W 600 nt3.48□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YDR089WYDR089W 2610 nt3.48□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YDR431WYDR431W 312 nt3.47□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YGL177WYGL177W 348 nt3.47□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 RPS25AYGR027C 327 nt3.47□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 HTD2YHR067W 843 nt3.47□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 TPM1YNL079C 600 nt3.47□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 YPL035CYPL035C 348 nt3.47□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 FDH2YPL275W 711 nt3.47□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 PHO88YBR106W 567 nt3.47□□□□□ -1.85
VPS54Q12071 VIP1YLR410W 3441 nt3.46□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 MRPL32YCR003W 552 nt3.46□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 YDR193WYDR193W 399 nt3.46□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 SPT2YER161C 1002 nt3.46□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 YIL161WYIL161W 708 nt3.46□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt3.46□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 SHH3YMR118C 591 nt3.46□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 RLP7YNL002C 969 nt3.46□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 MSM1YGR171C 1728 nt3.46□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 YTA7YGR270W 4140 nt3.46□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 CCM1YGR150C 2595 nt3.46□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 YDR131CYDR131C 1671 nt3.46□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 PEX1YKL197C 3132 nt3.45□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 TGL2YDR058C 981 nt3.45□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 SPT15YER148W 723 nt3.45□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 YGR064WYGR064W 369 nt3.45□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 MPC3YGR243W 441 nt3.45□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 BCD1YHR040W 1101 nt3.45□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 ALB1YJL122W 528 nt3.45□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 EMC2YJR088C 879 nt3.45□□□□□ -1.86
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