Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM27E3Q08E93 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM27E3Q08E93 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms