Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFF3Q07654 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFF3Q07654 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms