Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CKAP4Q07065 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms