Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTDSPL2Q05D32 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTDSPL2Q05D32 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms