Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTK2Q05397 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTK2Q05397 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms