Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms