Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAX2Q02962 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms