Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ID3Q02535 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ID3Q02535 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ID3Q02535 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ID3Q02535 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ID3Q02535 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ID3Q02535 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ID3Q02535 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ID3Q02535 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ID3Q02535 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ID3Q02535 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ID3Q02535 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ID3Q02535 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ID3Q02535 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ID3Q02535 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ID3Q02535 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ID3Q02535 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ID3Q02535 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ID3Q02535 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ID3Q02535 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ID3Q02535 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ID3Q02535 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ID3Q02535 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ID3Q02535 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ID3Q02535 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ID3Q02535 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ID3Q02535 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ID3Q02535 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ID3Q02535 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ID3Q02535 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ID3Q02535 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ID3Q02535 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ID3Q02535 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ID3Q02535 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ID3Q02535 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ID3Q02535 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ID3Q02535 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ID3Q02535 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ID3Q02535 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ID3Q02535 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ID3Q02535 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ID3Q02535 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ID3Q02535 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ID3Q02535 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ID3Q02535 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms