Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG1Q02413 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG1Q02413 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG1Q02413 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms