Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPIBQ01892 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIBQ01892 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms