Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
E2F1Q01094 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
E2F1Q01094 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F1Q01094 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms