Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF9Q00978 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms