Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDPQ00604 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDPQ00604 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDPQ00604 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NDPQ00604 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDPQ00604 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDPQ00604 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDPQ00604 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDPQ00604 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDPQ00604 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDPQ00604 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDPQ00604 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDPQ00604 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDPQ00604 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NDPQ00604 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDPQ00604 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NDPQ00604 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDPQ00604 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDPQ00604 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDPQ00604 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDPQ00604 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDPQ00604 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDPQ00604 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDPQ00604 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDPQ00604 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDPQ00604 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDPQ00604 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDPQ00604 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDPQ00604 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDPQ00604 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDPQ00604 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDPQ00604 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDPQ00604 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NDPQ00604 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDPQ00604 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDPQ00604 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDPQ00604 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDPQ00604 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDPQ00604 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NDPQ00604 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDPQ00604 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDPQ00604 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDPQ00604 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDPQ00604 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDPQ00604 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDPQ00604 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDPQ00604 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDPQ00604 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDPQ00604 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDPQ00604 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NDPQ00604 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDPQ00604 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDPQ00604 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDPQ00604 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDPQ00604 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NDPQ00604 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDPQ00604 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NDPQ00604 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDPQ00604 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDPQ00604 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDPQ00604 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDPQ00604 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDPQ00604 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDPQ00604 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDPQ00604 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDPQ00604 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NDPQ00604 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NDPQ00604 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDPQ00604 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDPQ00604 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDPQ00604 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDPQ00604 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDPQ00604 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDPQ00604 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDPQ00604 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDPQ00604 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDPQ00604 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDPQ00604 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDPQ00604 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDPQ00604 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDPQ00604 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDPQ00604 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms