Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAT1AQ00266 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAT1AQ00266 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms