Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX1P83916 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX1P83916 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX1P83916 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX1P83916 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX1P83916 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX1P83916 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX1P83916 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX1P83916 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX1P83916 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX1P83916 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX1P83916 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX1P83916 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX1P83916 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX1P83916 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX1P83916 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX1P83916 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBX1P83916 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBX1P83916 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBX1P83916 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBX1P83916 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX1P83916 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX1P83916 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX1P83916 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX1P83916 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX1P83916 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX1P83916 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX1P83916 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX1P83916 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX1P83916 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX1P83916 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX1P83916 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX1P83916 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX1P83916 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX1P83916 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX1P83916 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX1P83916 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX1P83916 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX1P83916 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX1P83916 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX1P83916 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX1P83916 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX1P83916 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX1P83916 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX1P83916 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX1P83916 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX1P83916 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX1P83916 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX1P83916 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX1P83916 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX1P83916 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX1P83916 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX1P83916 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX1P83916 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX1P83916 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX1P83916 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX1P83916 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX1P83916 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX1P83916 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX1P83916 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX1P83916 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX1P83916 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX1P83916 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX1P83916 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX1P83916 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX1P83916 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX1P83916 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX1P83916 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX1P83916 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX1P83916 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX1P83916 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX1P83916 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX1P83916 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX1P83916 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX1P83916 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX1P83916 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX1P83916 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX1P83916 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX1P83916 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms