Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP5P82980 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP5P82980 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP5P82980 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP5P82980 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP5P82980 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP5P82980 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP5P82980 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP5P82980 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP5P82980 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP5P82980 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP5P82980 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP5P82980 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP5P82980 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP5P82980 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP5P82980 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP5P82980 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP5P82980 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP5P82980 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP5P82980 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP5P82980 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP5P82980 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP5P82980 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP5P82980 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP5P82980 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP5P82980 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP5P82980 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP5P82980 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP5P82980 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP5P82980 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP5P82980 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP5P82980 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP5P82980 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP5P82980 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP5P82980 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP5P82980 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP5P82980 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP5P82980 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP5P82980 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP5P82980 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP5P82980 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP5P82980 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP5P82980 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP5P82980 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP5P82980 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP5P82980 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP5P82980 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP5P82980 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP5P82980 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP5P82980 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP5P82980 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP5P82980 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP5P82980 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP5P82980 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RBP5P82980 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBP5P82980 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBP5P82980 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBP5P82980 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP5P82980 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP5P82980 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP5P82980 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP5P82980 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP5P82980 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP5P82980 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP5P82980 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP5P82980 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP5P82980 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP5P82980 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP5P82980 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP5P82980 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP5P82980 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP5P82980 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP5P82980 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP5P82980 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP5P82980 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP5P82980 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP5P82980 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP5P82980 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP5P82980 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP5P82980 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP5P82980 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP5P82980 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP5P82980 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP5P82980 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP5P82980 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP5P82980 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP5P82980 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP5P82980 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP5P82980 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP5P82980 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP5P82980 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP5P82980 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP5P82980 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP5P82980 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP5P82980 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP5P82980 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP5P82980 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP5P82980 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP5P82980 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP5P82980 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms