Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRB1P82279 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRB1P82279 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRB1P82279 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRB1P82279 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRB1P82279 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRB1P82279 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRB1P82279 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRB1P82279 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRB1P82279 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRB1P82279 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRB1P82279 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRB1P82279 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRB1P82279 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRB1P82279 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRB1P82279 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRB1P82279 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRB1P82279 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRB1P82279 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRB1P82279 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRB1P82279 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRB1P82279 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRB1P82279 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRB1P82279 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRB1P82279 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRB1P82279 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRB1P82279 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRB1P82279 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRB1P82279 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRB1P82279 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRB1P82279 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRB1P82279 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRB1P82279 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CRB1P82279 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRB1P82279 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRB1P82279 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRB1P82279 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRB1P82279 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRB1P82279 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CRB1P82279 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CRB1P82279 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRB1P82279 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRB1P82279 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRB1P82279 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRB1P82279 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CRB1P82279 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRB1P82279 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRB1P82279 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRB1P82279 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CRB1P82279 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRB1P82279 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRB1P82279 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRB1P82279 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CRB1P82279 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRB1P82279 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRB1P82279 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRB1P82279 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRB1P82279 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRB1P82279 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRB1P82279 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRB1P82279 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRB1P82279 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CRB1P82279 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRB1P82279 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRB1P82279 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRB1P82279 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRB1P82279 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRB1P82279 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRB1P82279 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CRB1P82279 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRB1P82279 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRB1P82279 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRB1P82279 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRB1P82279 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CRB1P82279 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRB1P82279 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRB1P82279 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CRB1P82279 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRB1P82279 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRB1P82279 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRB1P82279 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms