Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNA1P78396 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNA1P78396 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms