Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP1P63208 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP1P63208 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP1P63208 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP1P63208 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP1P63208 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP1P63208 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP1P63208 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP1P63208 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP1P63208 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP1P63208 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP1P63208 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP1P63208 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP1P63208 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP1P63208 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP1P63208 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP1P63208 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP1P63208 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP1P63208 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP1P63208 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP1P63208 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP1P63208 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP1P63208 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP1P63208 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP1P63208 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP1P63208 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP1P63208 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP1P63208 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP1P63208 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP1P63208 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP1P63208 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP1P63208 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP1P63208 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP1P63208 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP1P63208 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP1P63208 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP1P63208 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP1P63208 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP1P63208 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP1P63208 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP1P63208 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP1P63208 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP1P63208 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP1P63208 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP1P63208 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP1P63208 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP1P63208 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP1P63208 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP1P63208 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP1P63208 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP1P63208 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP1P63208 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP1P63208 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP1P63208 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP1P63208 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP1P63208 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP1P63208 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP1P63208 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP1P63208 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP1P63208 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKP1P63208 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP1P63208 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP1P63208 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP1P63208 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP1P63208 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP1P63208 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP1P63208 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP1P63208 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP1P63208 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP1P63208 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP1P63208 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP1P63208 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP1P63208 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP1P63208 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKP1P63208 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP1P63208 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP1P63208 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP1P63208 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP1P63208 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP1P63208 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP1P63208 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP1P63208 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP1P63208 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP1P63208 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP1P63208 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP1P63208 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP1P63208 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP1P63208 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP1P63208 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKP1P63208 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKP1P63208 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms