Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBX1P62877 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBX1P62877 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBX1P62877 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBX1P62877 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBX1P62877 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBX1P62877 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBX1P62877 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBX1P62877 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBX1P62877 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBX1P62877 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBX1P62877 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBX1P62877 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBX1P62877 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBX1P62877 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBX1P62877 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBX1P62877 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBX1P62877 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBX1P62877 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBX1P62877 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBX1P62877 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RBX1P62877 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms