Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPI1P60174 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPI1P60174 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPI1P60174 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPI1P60174 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPI1P60174 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPI1P60174 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPI1P60174 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPI1P60174 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPI1P60174 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPI1P60174 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPI1P60174 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPI1P60174 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPI1P60174 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPI1P60174 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TPI1P60174 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPI1P60174 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPI1P60174 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPI1P60174 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPI1P60174 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPI1P60174 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPI1P60174 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPI1P60174 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPI1P60174 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TPI1P60174 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPI1P60174 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPI1P60174 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPI1P60174 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPI1P60174 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPI1P60174 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPI1P60174 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPI1P60174 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPI1P60174 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPI1P60174 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPI1P60174 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TPI1P60174 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPI1P60174 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPI1P60174 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPI1P60174 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPI1P60174 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPI1P60174 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPI1P60174 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPI1P60174 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPI1P60174 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPI1P60174 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPI1P60174 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPI1P60174 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPI1P60174 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPI1P60174 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPI1P60174 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPI1P60174 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPI1P60174 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPI1P60174 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TPI1P60174 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPI1P60174 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPI1P60174 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPI1P60174 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPI1P60174 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPI1P60174 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPI1P60174 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPI1P60174 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPI1P60174 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TPI1P60174 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TPI1P60174 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TPI1P60174 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TPI1P60174 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPI1P60174 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPI1P60174 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPI1P60174 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPI1P60174 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPI1P60174 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPI1P60174 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPI1P60174 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TPI1P60174 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPI1P60174 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPI1P60174 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPI1P60174 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPI1P60174 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPI1P60174 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPI1P60174 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms