Protein–RNA interactions for Protein: P59827

BPIFB4, BPI fold-containing family B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFB4P59827 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFB4P59827 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFB4P59827 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms