Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP11P59045 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP11P59045 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP11P59045 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP11P59045 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP11P59045 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP11P59045 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP11P59045 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRP11P59045 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP11P59045 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms