Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NLRP6P59044 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP6P59044 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP6P59044 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms