Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3BP58499 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3BP58499 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms