Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP1P56182 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP1P56182 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP1P56182 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP1P56182 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP1P56182 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP1P56182 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP1P56182 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP1P56182 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP1P56182 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP1P56182 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP1P56182 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP1P56182 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRP1P56182 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP1P56182 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP1P56182 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP1P56182 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP1P56182 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP1P56182 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP1P56182 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP1P56182 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP1P56182 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRP1P56182 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRP1P56182 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRP1P56182 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRP1P56182 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRP1P56182 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRP1P56182 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP1P56182 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP1P56182 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP1P56182 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP1P56182 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP1P56182 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP1P56182 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRP1P56182 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP1P56182 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP1P56182 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP1P56182 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP1P56182 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP1P56182 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP1P56182 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP1P56182 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP1P56182 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP1P56182 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP1P56182 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP1P56182 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP1P56182 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP1P56182 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP1P56182 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP1P56182 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRP1P56182 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RRP1P56182 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP1P56182 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP1P56182 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP1P56182 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP1P56182 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP1P56182 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP1P56182 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP1P56182 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RRP1P56182 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP1P56182 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP1P56182 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP1P56182 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP1P56182 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP1P56182 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP1P56182 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP1P56182 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP1P56182 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP1P56182 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP1P56182 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP1P56182 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRP1P56182 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP1P56182 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP1P56182 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP1P56182 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP1P56182 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP1P56182 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP1P56182 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP1P56182 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP1P56182 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms