Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC4P55056 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC4P55056 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC4P55056 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOC4P55056 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms