Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AIF1P55008 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIF1P55008 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIF1P55008 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIF1P55008 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIF1P55008 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AIF1P55008 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIF1P55008 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIF1P55008 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIF1P55008 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AIF1P55008 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIF1P55008 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIF1P55008 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIF1P55008 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIF1P55008 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIF1P55008 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIF1P55008 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIF1P55008 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIF1P55008 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIF1P55008 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIF1P55008 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIF1P55008 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIF1P55008 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIF1P55008 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIF1P55008 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIF1P55008 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIF1P55008 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIF1P55008 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIF1P55008 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AIF1P55008 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AIF1P55008 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AIF1P55008 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AIF1P55008 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AIF1P55008 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AIF1P55008 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AIF1P55008 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AIF1P55008 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AIF1P55008 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AIF1P55008 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AIF1P55008 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AIF1P55008 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AIF1P55008 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AIF1P55008 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AIF1P55008 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AIF1P55008 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AIF1P55008 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AIF1P55008 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AIF1P55008 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AIF1P55008 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AIF1P55008 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AIF1P55008 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AIF1P55008 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AIF1P55008 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AIF1P55008 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AIF1P55008 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AIF1P55008 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AIF1P55008 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AIF1P55008 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AIF1P55008 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AIF1P55008 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AIF1P55008 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AIF1P55008 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AIF1P55008 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AIF1P55008 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AIF1P55008 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AIF1P55008 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AIF1P55008 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AIF1P55008 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AIF1P55008 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AIF1P55008 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AIF1P55008 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIF1P55008 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIF1P55008 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIF1P55008 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIF1P55008 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIF1P55008 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIF1P55008 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIF1P55008 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIF1P55008 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIF1P55008 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIF1P55008 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIF1P55008 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AIF1P55008 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AIF1P55008 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AIF1P55008 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AIF1P55008 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AIF1P55008 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AIF1P55008 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AIF1P55008 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AIF1P55008 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AIF1P55008 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AIF1P55008 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AIF1P55008 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AIF1P55008 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AIF1P55008 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AIF1P55008 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIF1P55008 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIF1P55008 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIF1P55008 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIF1P55008 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms