Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB3P54753 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms