Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD23BP54727 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD23BP54727 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms