Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YARSP54577 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YARSP54577 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YARSP54577 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YARSP54577 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YARSP54577 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YARSP54577 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YARSP54577 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YARSP54577 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YARSP54577 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YARSP54577 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YARSP54577 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YARSP54577 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YARSP54577 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YARSP54577 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
YARSP54577 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YARSP54577 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YARSP54577 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YARSP54577 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YARSP54577 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YARSP54577 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YARSP54577 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YARSP54577 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YARSP54577 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YARSP54577 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YARSP54577 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YARSP54577 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YARSP54577 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YARSP54577 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YARSP54577 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YARSP54577 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YARSP54577 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YARSP54577 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YARSP54577 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YARSP54577 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YARSP54577 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YARSP54577 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YARSP54577 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YARSP54577 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YARSP54577 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YARSP54577 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YARSP54577 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YARSP54577 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YARSP54577 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
YARSP54577 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YARSP54577 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YARSP54577 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YARSP54577 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YARSP54577 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YARSP54577 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YARSP54577 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YARSP54577 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YARSP54577 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YARSP54577 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YARSP54577 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YARSP54577 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YARSP54577 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YARSP54577 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YARSP54577 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YARSP54577 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YARSP54577 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YARSP54577 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YARSP54577 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YARSP54577 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YARSP54577 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YARSP54577 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YARSP54577 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YARSP54577 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YARSP54577 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YARSP54577 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YARSP54577 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YARSP54577 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YARSP54577 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YARSP54577 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YARSP54577 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YARSP54577 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YARSP54577 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
YARSP54577 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YARSP54577 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YARSP54577 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YARSP54577 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YARSP54577 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YARSP54577 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YARSP54577 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YARSP54577 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YARSP54577 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YARSP54577 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YARSP54577 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
YARSP54577 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YARSP54577 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YARSP54577 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
YARSP54577 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YARSP54577 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YARSP54577 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YARSP54577 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YARSP54577 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YARSP54577 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YARSP54577 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YARSP54577 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YARSP54577 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms