Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRYBA4P53673 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRYBA4P53673 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms