Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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PGGT1BP53609 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGGT1BP53609 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PGGT1BP53609 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PGGT1BP53609 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PGGT1BP53609 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PGGT1BP53609 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGGT1BP53609 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PGGT1BP53609 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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PGGT1BP53609 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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PGGT1BP53609 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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