Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDST1P52848 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDST1P52848 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDST1P52848 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDST1P52848 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDST1P52848 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDST1P52848 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDST1P52848 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDST1P52848 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDST1P52848 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDST1P52848 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDST1P52848 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDST1P52848 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDST1P52848 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDST1P52848 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDST1P52848 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDST1P52848 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDST1P52848 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDST1P52848 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDST1P52848 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDST1P52848 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDST1P52848 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDST1P52848 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDST1P52848 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDST1P52848 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDST1P52848 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDST1P52848 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDST1P52848 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDST1P52848 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDST1P52848 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDST1P52848 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDST1P52848 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDST1P52848 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDST1P52848 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDST1P52848 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDST1P52848 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDST1P52848 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST1P52848 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST1P52848 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST1P52848 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDST1P52848 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms