Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF140P52738 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF140P52738 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF140P52738 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF140P52738 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF140P52738 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF140P52738 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF140P52738 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF140P52738 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF140P52738 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF140P52738 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF140P52738 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF140P52738 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF140P52738 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF140P52738 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF140P52738 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF140P52738 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF140P52738 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF140P52738 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF140P52738 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF140P52738 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF140P52738 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF140P52738 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF140P52738 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF140P52738 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF140P52738 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF140P52738 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF140P52738 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF140P52738 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF140P52738 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF140P52738 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF140P52738 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF140P52738 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF140P52738 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF140P52738 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF140P52738 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF140P52738 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF140P52738 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF140P52738 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF140P52738 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF140P52738 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF140P52738 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF140P52738 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF140P52738 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF140P52738 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF140P52738 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF140P52738 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF140P52738 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF140P52738 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF140P52738 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF140P52738 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF140P52738 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF140P52738 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF140P52738 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF140P52738 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms